Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTGDRQ13258 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTGDRQ13258 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTGDRQ13258 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTGDRQ13258 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTGDRQ13258 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTGDRQ13258 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTGDRQ13258 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTGDRQ13258 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTGDRQ13258 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGDRQ13258 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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