Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF1Q13077 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF1Q13077 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF1Q13077 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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TRAF1Q13077 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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TRAF1Q13077 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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TRAF1Q13077 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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TRAF1Q13077 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF1Q13077 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF1Q13077 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAF1Q13077 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAF1Q13077 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF1Q13077 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF1Q13077 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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