Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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