Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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