Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECH1Q13011 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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