Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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