Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPRJQ12913 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPRJQ12913 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPRJQ12913 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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