Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXO1Q12778 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXO1Q12778 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXO1Q12778 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
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FOXO1Q12778 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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