Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SMAGPQ0VAQ4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMAGPQ0VAQ4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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