Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms