Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms