Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms