Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC25A11Q02978 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A11Q02978 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms