Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms