Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms