Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FAM3AP98173 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FAM3AP98173 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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