Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms