Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB2P80303 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB2P80303 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB2P80303 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB2P80303 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB2P80303 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUCB2P80303 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB2P80303 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB2P80303 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB2P80303 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUCB2P80303 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms