Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms