Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS28P62857 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS28P62857 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS28P62857 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS28P62857 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS28P62857 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms