Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF6P62330 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF6P62330 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms