Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ERVFC1-1P60608 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms