Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms