Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms