Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA1P56159 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms