Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKX2-5P52952 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms