Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBP2P50120 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBP2P50120 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBP2P50120 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBP2P50120 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBP2P50120 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP2P50120 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP2P50120 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP2P50120 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP2P50120 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP2P50120 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP2P50120 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP2P50120 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP2P50120 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP2P50120 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP2P50120 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms