Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRE11P49959 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRE11P49959 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRE11P49959 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms