Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRATP43155 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRATP43155 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRATP43155 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CRATP43155 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CRATP43155 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRATP43155 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRATP43155 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRATP43155 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRATP43155 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms