Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF5P43026 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF5P43026 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GDF5P43026 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GDF5P43026 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms