Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FDFT1P37268 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms