Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms