Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GJC1P36383 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GJC1P36383 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GJC1P36383 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GJC1P36383 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms