Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3AP31941 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms