Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRB3P28472 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRB3P28472 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms