Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APCP25054 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
APCP25054 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APCP25054 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APCP25054 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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