Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ME2P23368 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ME2P23368 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME2P23368 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME2P23368 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME2P23368 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME2P23368 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms