Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XBP1P17861 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XBP1P17861 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XBP1P17861 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XBP1P17861 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XBP1P17861 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XBP1P17861 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XBP1P17861 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms