Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms