Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms