Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCCAP05165 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCCAP05165 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCCAP05165 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCCAP05165 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCCAP05165 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCCAP05165 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCCAP05165 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms