Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX7O95931 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX7O95931 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms