Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPNO60542 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSPNO60542 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSPNO60542 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSPNO60542 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSPNO60542 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSPNO60542 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSPNO60542 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSPNO60542 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPNO60542 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSPNO60542 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSPNO60542 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSPNO60542 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSPNO60542 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSPNO60542 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSPNO60542 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms