Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX16O60231 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX16O60231 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX16O60231 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms