Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM6AO15550 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM6AO15550 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms