Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD28O15084 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms