Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms