Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM200CA6NKL6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM200CA6NKL6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms