Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYCE3A1L190 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYCE3A1L190 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms