Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF2Q9Y5W3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms